Общие вопросы

> Желательно на примере дерева которое попроще: http://dhtml.ru/howto/simpletree/
> Вот как для этого дерева открыть все ветки одним кликом?

Для конкретного дерева нужно придумывать конкретный способ.
А для того, что бы выполнить операцию над всеми Дивами на странице, нужно получить их список, а протись циклом:
aDiv = document.getElementsByTagName('DIV');
for (i in aDiv) {
aDiv[i]....
}