Общие вопросы

>> А как мне передать объект в новое окно, открытое через window.open()?

> в принципе, DOM основного окна доступен из "новооткрытого" через указатель window.opener
> в другую сторону можно обращаться через указатель, который возвращает сам window.open()

Ага, я как раз таким образом проблему и решил:

// В первом окне:

window['my-data'] = myData;
window.open (...)

// В новом окне:

var myData = window.opener['my-data'];

Во всяком случае, в IE 6.0 и в NN 7.0 работает, думаю, должно и в версиях чуть пораньше сработать.

P.S.: неплохо бы добавить сие решение в ваше сочинение по поводу модальных окон, поскольку решает единственную реальную проблему использования немодальных окон.